Merge pull request #14 from PharmCat/dev

metadata

Project.toml

@@ -1,7 +1,7 @@
 name = "MetidaBase"
 uuid = "075456b7-4006-432f-9324-2f8453996c49"
 authors = ["PharmCat <[email protected]> and contributors"]
-version = "0.13.0"
+version = "0.14.0"
 
 [deps]
 CategoricalArrays = "324d7699-5711-5eae-9e2f-1d82baa6b597"

src/dataset.jl

@@ -3,6 +3,13 @@
 ################################################################################
 struct DataSet{T <: AbstractData} <: AbstractDataSet{AbstractData}
     ds::Vector{T}
+    metadata::Dict
+    function DataSet(ds::AbstractVector{T}, metadata::Dict) where T <: AbstractData
+        new{T}(ds, metadata)::DataSet
+    end
+    function DataSet(ds)
+        DataSet(ds, Dict{Symbol, Any}())
+    end
 end
 
 function getdata(d::DataSet)

src/utils.jl

@@ -67,6 +67,18 @@ ispositive(::Nothing) = false
 ispositive(x::AbstractFloat) = isnan(x) ? false : x > zero(x)
 ispositive(x) = x > zero(x)
 
+
+
+################################################################################
+# Group keyword parsing
+################################################################################
+
+parse_gkw(s::String) = [Symbol(s)]
+parse_gkw(s::Symbol) = [s]
+parse_gkw(s::AbstractVector{<:AbstractString}) = Symbol.(s)
+parse_gkw(s::AbstractVector{Symbol}) = s
+
+
 ################################################################################
 ################################################################################
 

test/runtests.jl

@@ -121,6 +121,9 @@ using Test, Tables, TypedTables, DataFrames, CSV
     end
     exrsds = MetidaBase.DataSet(exrsdsv)
 
+    # metadata
+    dsmeta = MetidaBase.DataSet(exrsdsv, Dict(:name => "SomeName"))
+
     # Index
     @test exrsds[:, :r1][1] == 3
     @test exrsds[1, :r1] == 3
@@ -235,4 +238,9 @@ using Test, Tables, TypedTables, DataFrames, CSV
     MetidaBase.cvfromvar(0.4) ≈ 0.7013021443295824
     MetidaBase.cvfromsd(0.4) ≈ 0.41654636115540644
 
+
+    @test  MetidaBase.parse_gkw("s")    == [:s]
+    @test  MetidaBase.parse_gkw(:s)     == [:s]
+    @test  MetidaBase.parse_gkw([:s])   == [:s]
+    @test  MetidaBase.parse_gkw(["s"])  == [:s]
 end