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gvaleman/GT.XMLtoData

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GT.XMLtoData: A Genome Detective XML Data Extractor

GT.XMLtoData is a Python script designed to simplify the process of extracting and analyzing data from Genome Detective's XML files. These XML files, while comprehensive in their analysis, are often complex and not straightforward for data manipulation. Our script tackles this by parsing the XML file, extracting key information such as sequence names, lengths, alignment details, and protein mutations, and then converting this data into a user-friendly pandas DataFrame. This transformation makes it easier for researchers and data analysts to perform further analysis, visualize data, or export it for use in other applications. Español

GT.XMLtoData: Un Extractor de Datos XML de Genome Detective

GT.XMLtoData es un script en Python diseñado para simplificar el proceso de extracción y análisis de datos de archivos XML de Genome Detective. Estos archivos XML, aunque completos en su análisis, suelen ser complejos y no directos para la manipulación de datos. Nuestro script aborda esto analizando el archivo XML, extrayendo información clave como nombres y longitudes de secuencias, detalles de alineación y mutaciones de proteínas, y luego convirtiendo estos datos en un DataFrame de pandas fácil de usar. Esta transformación facilita a los investigadores y analistas de datos realizar análisis adicionales, visualizar datos o exportarlos para su uso en otras aplicaciones.

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